은평구 진관내동 북한산성 입구에 위치해 산림 생태계와 조화를 이루고 있으며 도롱뇽, 산개구리 등 서울시 보호종이 관찰되는 곳이다. 2011년 국립공원관리공단 북한산국립공원사무소는 수환경 및 수서생태계 보호를 목적으로 은평구 진관동에 위치한 진관사 계곡(약0.5㎞, 3500㎡)을 북한산국립공원 특별보호구로 지정했다. 때문에 츨입이 제한되어 진관사 무료주차장 아래 마실길 근린공원 근처의 구역에서만 물놀이를 즐길 수 있다.