국보 제176호 홍치 2년명 청화백자송죽문호, 보물 제569호 안중근의사 유묵, 보물 제741호 전 대구 동화사 비로암 삼층석답 납석사리호, 보물 제742호 남석제삼존불비상, 보물 제 743호 정조대왕필 파초도, 보물 1430-2호 봉수당 진찬도 등 다수의 국보, 보물, 시유형문화재등을 소장하고 있음

주요 사업으로는 국내외의 학술조사사업, 학술지 발간, 특별전 등을 들 수 있다. 지금까지 행한 주요 학술조사는 선사미술 연구에 획기적인 공헌을 한 울주 반구대와 천전리 암벽조각의 발견·조사, 충남 부여 임강사지, 충남 보령 성주사지, 경주 분황사, 강원도 양양 선림원지, 경기도 광주 동사지와 강화 선원사지 등의 발굴조사 그리고 일본 대마도와 실크로드 학술조사 등을 들 수 있다. 그 외에도 고려사경특별전, 한국고승진영전, 고려불화특별전, 국보 · 보물 귀중본전, 조선불화초본전, 불 · 법 · 승전 등의 다양한 특별전을 개최하여 각계의 호응을 받았고, 대학박물관으로서는 최초로 전문학술지인 <<불교미술>>을 발간하여 깊이 있는 연구 활동을 지속하고 있다.