《거북이 특공대 Z》(영어: Teenage Mutant Ninja Turtles)는 미국의 미라지 스튜디오와 대한민국의 동우 애니메이션이 협력제작을 하여 탄생하게 된 닌자 거북이의 새로운 애니메이션 시리즈이다. 캐릭터 디자인이 1987년 시리즈보다 상당히 날카로워졌고, 분위기도 훨씬 어둡게 재현이 되었다. 미국에서는 2003년 2월 8일에 시즌1을 방영하기 시작해서, 2009년 11월 21일에 Turtles Forever를 끝으로 종영하였다.

대한민국에서는 2006년 9월 21일부터 2007년 5월 31일까지 SBS에서 '거북이 특공대Z'라는 제목으로 매주 수요일과 목요일에 방영되었고, 2008년 6월 17일부터 매주 화요일에 재방영을 하고 있었다가 도중에 종영을 한 상태이다. 현재 시즌2까지 방영되었고, 시즌3 부터의 방영 계획은 아직 없다.